발효공학에서 균주의 생산성 증대는 단순히 배양 조건을 개선하는 것을 넘어, 미생물 세포 내의 대사 플럭스를 체계적으로 조절하여 목표 물질로의 탄소 흐름을 최대화하는 데 달려 있습니다.
대사 흐름 제어의 기본 원리
- 경로 재설계: 원하는 최종 산물의 전구체가 되는 특정 대사 경로의 속도를 높이고, 부산물로 빠져나가는 경쟁 경로를 억제합니다. 이는 주로 해당과정이나 TCA 회로의 특정 효소 활성을 타겟팅합니다.
- 시스템 통합 분석: 오믹스 통합 분석 결과를 활용하여, 특정 대사 중간체의 농도가 어떻게 전체 대사 네트워크의 균형을 깨뜨리는지 진단하고, 이를 해결하기 위한 유전자 편집(예: CRISPR 유전자 편집)을 적용합니다.
궁극적으로 이 전략은 세포의 에너지 상태(ATP, NAD+/NADH)와 외부 환경 신호를 통합적으로 고려하여, 가장 효율적인 대사체 신호 기반의 균주를 구축하는 것을 목표로 합니다. 합성생물학 기술과의 융합이 필수적입니다.
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